海绵Pacnychalina sp.体内古菌多样性非培养技术分析

• 作者: 张开山 方再光 潘志强 鲍时翔 黄惠琴
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 海绵Pachychalina sp.,16S rDNA,ARDRA,古菌多样性
• 年，卷（期）: 2005,（1）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 121-124
• 页数: 4页
• 分类号: Q931
• 字数: 3140字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0001-6209.2005.01.027

摘要

采用非分离培养分析方法,即16S rDNA限制性酶切片段长度多态性(ARDRA)和测序方法对南海湛江海域海绵Pachychalina sp.体内的古菌多样性进行了研究.从海绵体内直接提取古菌总DNA.以样品总DNA为模板,用古菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增获得16S rDNA,回收、纯化16S rDNA产物并克隆到T-Vector.进行第二次PCR扩增反应,且对扩增产物进行ARDRA.在古菌16S rDNA的ARDRA图谱中,大多数克隆的酶切带谱上存在差异;随机挑选8个克隆子进行测序,获得古菌16S rDNA的部分序列,并对16S rDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树,结果发现海绵体内的古菌主要属于Methanogenium organophilum、Methanoplanus petrolearius等古菌类.但它们与目前数据库中收录的古细菌间的相似性均不超过90%,它们极有可能是一些新的古菌.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	鲍时翔	中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室	86	711	16.0	23.0
2	黄惠琴	中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室	70	592	15.0	22.0
3	张开山	中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室	4	20	2.0	4.0
4	潘志强	中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室	2	8	2.0	2.0
5	方再光	中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室	2	13	2.0	2.0