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北京市褐家鼠种群遗传多态性及与汉坦病毒分布关系的研究
北京市褐家鼠种群遗传多态性及与汉坦病毒分布关系的研究
作者:
吴晓明
左曙青
张泮河
敦哲
曹务春
江佳富
王日明
王炳才
郭天宇
陈立泉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
褐家鼠
遗传多态性
随机扩增多态DNA
汉坦病毒
摘要:
目的了解北京地区褐家鼠不同地理种群遗传多态性与该地区汉坦病毒(HV)基因变异及其分布可能存在的关联.方法选取北京市不同地区捕获褐家鼠,采用巢式RT-PCR法检测HVM基因片段,获得的阳性标本产物进行直接测序,构建系统发育树.另一方面对不同HV来源的宿主个体和其对应种群内随机选取的其他个体,以及其他一些地区鼠类作为参照,用随机扩增多态DNA(RAPD)技术获得褐家鼠基因组DNA多态性图谱,利用RAPDDIST和PHYLIP软件分析褐家鼠种群多态性,并与对应的北京地区的HV差异和分布进行比较.结果选用50个随机引物进行扩增,有5个引物获得清晰、多态性高的RAPD谱带.不同区域种群RAPD标记不尽相同,北京市褐家鼠地理种群之间存在一定程度的遗传分化,大部分种群遗传距离较为接近,其中采集于某农产品集散地的XFD种群遗传距离相对较大,有特异性标记条带.11个HV代表序列均为汉城型汉坦病毒,基因差异为0.1%~8.0%,可分为2个主要的支系,多数毒株变异类型在不同地域中交叉分布,但BjFT01株变异较大,成一个独立的支系.通过Bootstrap分析和系统树图比较,种群分化较大的XFD种群与该区获得1株亲缘关系相对较远的HV相对应.结论北京市不同区域HV及其褐家鼠DNA多态性均存在一定差异,不同种群尤其是输入性种群对北京HV流行影响程度不同,初步显示一些特定种群与特定的基因性别有一定的关联.XFD种群外源基因交流渗入的可能性较大,进一步证明北京市HV随着鼠类种群迁移输入的可能性极大,但仍有待于选用一些特异性标记基因多态性进行继续研究.
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汉坦病毒
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文献信息
篇名
北京市褐家鼠种群遗传多态性及与汉坦病毒分布关系的研究
来源期刊
中国媒介生物学及控制杂志
学科
医学
关键词
褐家鼠
遗传多态性
随机扩增多态DNA
汉坦病毒
年,卷(期)
2005,(5)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
358-363
页数
6页
分类号
R18
字数
5574字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1003-4692.2005.05.010
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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遗传多态性
随机扩增多态DNA
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
中国媒介生物学及控制杂志
主办单位:
中国疾病预防控制中心
出版周期:
双月刊
ISSN:
1003-8280
CN:
13-1142/R
开本:
大16开
出版地:
北京市昌平区昌百路155号
邮发代号:
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
5223
总下载数(次)
3
总被引数(次)
24162
相关基金
北京市自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Beijing Province
官方网址:
http://210.76.125.39/zrjjh/zrjj/
项目类型:
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学科类型:
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中国媒介生物学及控制杂志2005年第4期
中国媒介生物学及控制杂志2005年第3期
中国媒介生物学及控制杂志2005年第2期
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