水稻(Oryza sativa L.)捕光叶绿素a/b结合蛋白基因全长cDNA的克隆和特性分析

• 作者: 向太和 庞基良 王利琳
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 水稻 叶绿素a/b结合蛋白基因 基因克隆 分析
• 年，卷（期）: 2005,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1227-1232
• 页数: 6页
• 分类号: S511
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0496-3490.2005.09.021

摘要

根据捕光叶绿素a/b结合蛋白基因(cab)家族中的保守序列设计PCR引物,扩增出的约310 bp cDNA小片段为分子杂交探针,对构建的水稻cDNA文库进行杂交筛选,并结合PCR分析确定阳性克隆中cDNA片段的大小.通过对插入的cDNA片段最长的阳性克隆进行测序分析验证,克隆了水稻中1个cab基因全长cDNA,命名为cab-n8(GenBank登记号:AY445626).cab-n8长为1 128 bp,从第55 bp开始至789 bp含有1个开放阅读框和1个终止密码子,编码244个氨基酸(GenBank登记号为AAR19267.1);在3'端含有330 bp的非编码区和Poly(A)18;在5'端有45 bp的非编码区,在转录起始位点附近有TCA序列.通过序列分析,cab-n8编码的蛋白质在第54～216位包括典型的捕光叶绿素a/b结合蛋白功能域(chlorophll a/b binding domain);在第141～158位含有无名指结构功能域(ring finger structure domain),该位点可能与捕光叶绿素结合蛋白与叶绿素a/b的结合有关;在第194～231位含有甘油醛-3-磷酸脱氢酶C端功能域(C-terminal domain ofglyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like).cab-n8编码的蛋白质预测的等电点和分子量分别为6.52和26 955.80 Da.通过比较分析,cab-n8 DNA序列(AY445626)和编码的氨基酸序列(AAR19267.1)与cab27 DNA序列(AF094775.1)和编码的氨基酸序列(AAC67557.1)相似性最高,均为97%,显示cab家族基因在进化过程中是相当保守的.Northern blot分析表明,该基因在水稻叶和茎中表达没有差异,但光对其表达有明显的诱导促进作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王利琳	杭州师范学院生命科学学院	61	731	15.0	23.0
2	庞基良	杭州师范学院生命科学学院	45	576	13.0	22.0
3	向太和	杭州师范学院生命科学学院	32	321	10.0	16.0