超级刀片计算机上任务并行生物计算程序的效率优化

• 作者: 张成岗 李稚锋 杭兴宜 翁景然 赵东升
• 来源期刊: 军事医学科学院院刊
• 学科: 工学
• 关键词: 计算生物学 生物医学研究 超级刀片计算机 节点 计算资源 软件
• 年，卷（期）: 2005,（6）
• 所属期刊栏目: 技术方法
• 页码范围: 550-553
• 页数: 4页
• 分类号: TP393
• 字数: 5342字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-9960.2005.06.016

摘要

在后基因组时代,基因结构、功能及其与疾病的关系已成为生物医学的研究热点.在各种实验技术飞速发展的促进下,高复杂度、多元化、海量的生物数据正以指数级的速度不断增长,关于这些数据的存储、计算、分析等已成为严峻挑战.以超级计算机为平台的高性能计算是解决此类难题的有效方法之一.根据对本院超级刀片计算机的使用情况,本文从数据存储、通讯优化、计算效率、资源分配等角度,分析和总结提高任务并行的生物计算程序效率的技术策略,并进一步展望其在生物医学中的应用前景.这些技术策略对于使用同类高性能计算机具有重要的参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李稚锋	军事医学科学院放射与辐射医学研究所	10	66	5.0	8.0
5	张成岗	军事医学科学院放射与辐射医学研究所	123	1156	18.0	28.0
6	杭兴宜	军事医学科学院放射与辐射医学研究所	11	33	4.0	5.0
7	赵东升	军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所	72	313	9.0	13.0
8	翁景然	军事医学科学院放射与辐射医学研究所	2	9	1.0	2.0