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摘要:
对大白菜(Brassicacampestris L.ssp pekinensis)13007个EST序列进行拼接共得到7 714个片段重叠群(contig),其中10.4%(890个)非冗余EST含有SSR标记(EST-SSR),标记间平均间隔距离为3.9 kb,单、双和三核苷酸重复序列大约各占1/3左右.CDS所包含的三核苷酸重复序列最多,而且AAG/CTT重复序列的含量最高.通过同源性比较分析,获得功能已知的SSR-ESTs 774个,共计含有846个SSR,其中50.2%位于5'-UTR,31.4%位于3'-UTR,18.4%位于CDS.实验选取123个SSR座位设计引物,利用芜菁花叶病毒(Turnip mosaic girus,TuMV)的高抗和高感大白菜F6代自交系材料各2份,分析EST-SSR标记多态性.结果表明,其中37个标记可进行有效扩增,但是没有表现出多态性,23个标记(18.7%)至少在1份材料中具有多态性.对这些EST-SSR标记在大白菜和其它芸薹属植物的系统发育关系分析、遗传作图和基因定位的应用进行了讨论.
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内容分析
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文献信息
篇名 大白菜表达序列标签SSR标记分析
来源期刊 农业生物技术学报 学科 农学
关键词 EST EST-SSR 大白菜
年,卷(期) 2005,(4) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 423-428
页数 6页 分类号 S18
字数 3998字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-7968.2005.04.004
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 崔崇士 东北农业大学园艺学院 119 1485 21.0 30.0
2 马荣才 27 737 13.0 27.0
4 洪剑明 首都师范大学生命科学学院 62 1012 18.0 31.0
5 谢华 7 192 6.0 7.0
8 葛佳 1 47 1.0 1.0
传播情况
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引文网络
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二级参考文献  (0)
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研究主题发展历程
节点文献
EST
EST-SSR
大白菜
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
月刊
1674-7968
11-3342/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
2-367
1993
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:http://www.863.org.cn
项目类型:重点项目
学科类型:信息技术
论文1v1指导