乙型肝炎病毒X基因区序列的系统发育树分析

• 作者: 孙桂菊 屠红 张豪 钱耕荪
• 来源期刊: 东南大学学报(医学版)
• 学科: 医学
• 关键词: 乙型肝炎病毒 基因型 系统发育树 X基因
• 年，卷（期）: 2005,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 143-146
• 页数: 4页
• 分类号: R512.62|Q939.4
• 字数: 2128字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-6264.2005.03.001

摘要

目的:研究利用乙型肝炎病毒X基因区序列构建系统发育树进行基因型分析的可靠性.方法:从美国NCBI基因库中下载HBV全基因序列共249条,其中166条为已知基因型的序列,83条为未知型序列.利用ClustalX 1.8软件和TreeView软件对已知基因型的X区序列构建进化树图,分析由该方法获得的基因型是否与原来的吻合,并对未知型序列进行基因型分析,再用S区的进化树分析加以验证.结果:已明确基因型的166条序列利用X基因区序列分析得到的基因型与原先的基因型完全吻合.用X区和S区序列分析方法对83条未知型序列分析的结果是一致的,分别获得A型16条、B型17条、C型27条、D型21条及F型2条,未发现E、G和H型.结论:利用乙型肝炎病毒X基因区序列进行基因型分析是完全可靠的,有助于HBV的致病机制研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙桂菊	东南大学公共卫生学院营养与食品卫生学系	163	1895	25.0	37.0
2	钱耕荪		25	275	9.0	16.0
3	张豪	东南大学公共卫生学院营养与食品卫生学系	4	54	4.0	4.0
7	屠红		15	121	6.0	10.0