白菜种传黑斑病菌rDNA ITS区序列分析

• 作者: Hasan BOLKAN 师迎春 李健强 肖长坤 郑建秋
• 来源期刊: 菌物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 聚类分析 分类鉴定 A.brassicae A.brassicicola A.japonica
• 年，卷（期）: 2005,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 414-421
• 页数: 8页
• 分类号: Q939.96
• 字数: 4104字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-6472.2005.03.017

摘要

本文以来自国内外的20株白菜黑斑病菌及近源种为研究材料,进行了5.8S rDNA及其侧翼ITS区的克隆、测序、序列变异及遗传进化关系分析.黑斑病菌及其近源种真菌核糖体5.8S rDNA及其侧翼ITS区序列比对结果显示,不同种菌株ITS1比ITS2在碱基构成上有更大变异,而且ITS1的序列长度变异比ITS2的大;而种内虽然各菌株的寄主和地理来源不同,但ITS1和ITS2在长度上均没有变异,碱基构成上存在微小的变异.对该区序列的聚类分析表明,白菜黑斑病菌3个种芸薹链格孢Alternaria brassicae、甘蓝链格孢A.brassicicola和萝卜链格孢A.japonica虽然地理来源和寄主不同,但种内的不同菌株均在一个独立的聚类组中,种之间以及其和链格孢属内其它种在聚类关系上能明显分开,可基于该区进行黑斑病菌的分类鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李健强	中国农业大学农学与生物技术学院植物病理系	118	1716	24.0	33.0