应用表达芯片筛选小鼠肝癌淋巴道转移相关基因

• 作者: 侯力 周春辉 唐建武 宋波 崔晓楠 李晓枫 王波 郑仁恕
• 来源期刊: 临床与实验病理学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝肿瘤 肿瘤转移 Hca-F Hca-P 基因芯片 小鼠
• 年，卷（期）: 2005,（6）
• 所属期刊栏目: 实验病理学
• 页码范围: 701-706
• 页数: 6页
• 分类号: R735.7|R394.2
• 字数: 3797字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7399.2005.06.017

摘要

目的采用表达芯片比较高、低淋巴道转移力小鼠肝癌腹水型细胞株Hca-F和Hca-P的基因表达谱,以筛选出与肿瘤淋巴道转移相关的基因.方法分别提取Hca-F和Hca-P细胞的总RNA,反转录合成生物素标记的cRNA探针,并与Affymetrix GeneChip MOE430A(包括22 690个转录本,对应于约14 500个小鼠已知基因和4 371个EST)杂交,检测结果利用生物信息学进行分析.结果 Hca-F和Hca-P相比,在14 500个已知基因中,有901个(6.2%)表达上调幅度≥2倍;在4 371个EST中,有129个(3%)上调幅度≥2倍.公布了差异表达≥8倍的37个基因并根据Gene Ontology(GO)分类和TreeView分析,按照其参与的生物学过程和具有的分子功能进行了功能分类.其中有19个基因参与了组织发生、细胞黏附、信号转导、细胞生长、分化及代谢等的生物学过程,29个基因分别具有转运、移动、蛋白激酶、蛋白结合及受体活性等分子功能,7个基因的生物学功能尚不清楚.结论表达芯片检测与肿瘤淋巴道转移模型相结合,为肿瘤转移研究提供新方法、新思路,一些过量表达的基因将为肿瘤转移机制的研究提供新线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周春辉	大连医科大学病理学教研室	14	140	5.0	11.0
2	郑仁恕	大连医科大学病理学教研室	24	162	7.0	11.0
3	侯力	大连医科大学病理学教研室	22	146	5.0	12.0
4	崔晓楠	大连医科大学附属第一医院肿瘤科	36	187	7.0	12.0
5	王波	大连医科大学病理学教研室	81	507	11.0	17.0
6	宋波	大连医科大学病理学教研室	34	194	6.0	13.0
7	李晓枫	大连医科大学流行病学教研室	75	602	14.0	20.0
8	唐建武	大连医科大学病理学教研室	96	679	14.0	22.0