硫化镍转化人支气管上皮细胞基因差异表达芯片的研究

• 作者: 吕嘉春 宾晓农 纪卫东 谭敏 陈家堃
• 来源期刊: 中国肺癌杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 硫化镍 人支气管上皮细胞 基因芯片
• 年，卷（期）: 2005,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 412-418
• 页数: 7页
• 分类号: R135|R994.3
• 字数: 5352字
• 语种: 中文

摘要

背景与目的近年研究发现硫化镍(NiS)可引起人支气管上皮细胞(human bronchial epithelial cell,16HBE)发生恶性转化及转化细胞致癌性,其机制可能与NiS引起基因突变、多种转录因子的异常表达有关.为此,本研究利用NiS恶性转化的体外培养细胞模型,用cDNA微阵列技术研究经NiS转化后的16HBE细胞基因的差异表达,从基因组水平探讨NiS所致细胞恶变的相关基因差异改变.方法分别提取16HBE和经NiS单独处理发生转化的NiS-16HBE细胞的总RNA,逆转录合成cDNA并以Cy3-dCTP和Cy5-dCTP荧光素分别标记制作探针.探针混合后与含4000个人类基因的芯片杂交.以ScanArray 4000扫描仪扫描芯片,以GenPix Pro 3.0软件分析荧光信号,然后对差异表达的基因进行生物学信息分析.结果 NiS-16HBE细胞样本与16HBE细胞样本比较,呈现差异表达的基因有151个(3.78%),其中81个(53.64%)上调,70个(46.36%)下调.结论 NiS的转化作用与应激反应基因、免疫相关基因、DNA合成和修复基因、代谢相关基因、原癌基因和抑癌基因等多类基因的异常表达有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈家堃	广州医学院化学致癌研究所	77	467	11.0	17.0
2	吕嘉春	广州医学院化学致癌研究所	112	1265	17.0	30.0
3	宾晓农	广州医学院化学致癌研究所	48	362	11.0	16.0
4	纪卫东	广州医学院化学致癌研究所	43	221	8.0	12.0
5	谭敏	广东省中医院病理科	15	144	7.0	11.0