应用肿瘤基因解剖工程数据库检测大肠癌基因表达谱

• 作者: 冉志华 萧树东 陆玮 陈锦先 黄志刚
• 来源期刊: 中华消化杂志
• 关键词: 基因表达短序列 大肠癌 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 79-82
• 页数: 4页
• 字数: 3333字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j.issn:0254-1432.2005.02.005

摘要

目的进一步了解大肠癌与正常组织间基因表达谱差异,寻找可能用于临床诊断和治疗的基因标志.方法应用肿瘤基因解剖工程(CGAP)数据库中基因表达短序列分析(SAGE)数据筛查大肠癌和正常组织差异表达基因,并用RT-PCR方法进一步在大肠癌细胞株(SW1116、Lovo、HCT-8、Hce-8693)和20例组织标本中验证.结果在SAGE数据库中共分析大肠癌和正常组织短序列195 160个,发现差异基因216个.对其中17个基因进行RT-PCR验证分析,在细胞株中基因检出阳性率为35.3%～76.5%,组织标本中阳性率为88.2%.对其中转化生长因子β1、蛋白酶体26S亚单位、热休克蛋白1进行半定量RT-PCR,基因差异表达率分别为60%、50%、35%.结论利用CGAP数据库中SAGE数据能快捷、可靠地筛查大肠癌差异基因表达谱,对这些差异基因进一步分析可能为临床诊治大肠癌提供基因标志.