寡核苷酸微阵列技术用于检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药相关23S rRNA基因多态性

• 作者: 厉有名 徐磊 王群燕 虞朝辉 陈韶华
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 幽门螺杆菌 耐药 基因多态性
• 年，卷（期）: 2006,（11）
• 所属期刊栏目: 检测技术
• 页码范围: 1053-1056
• 页数: 4页
• 分类号: R4
• 字数: 3186字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2006.11.022

摘要

目的 幽门螺杆菌(Hp)克拉霉素耐药与23S rRNA基因A2142G、A2143G和C2182T点突变相关.本研究旨在探索建立一种快速、简便的检测方法,获取Hp克拉霉素耐药相关23S rRNA基因多态性的流行病学资料,为临床合理用药提供依据.方法 收集胃黏膜标本,用于病理检查、提取DNA.根据核苷酸位点设计相应探针,探针3'端以氨基修饰,氨基与探针序列之间以间隔臂相连,将探针用芯片点样仪点至玻片上.下游引物5'末端用Cy3荧光标记,进行不对称PCR扩增.其产物与芯片杂交,杂交后洗涤、扫描芯片,观察信号强度.非荧光标记引物扩增PCR产物克隆至T载体,测序验证芯片结果.结果 (1)寡核苷酸微阵列技术与测序检测Hp23S rRNA基因多态性结果完全一致.(2)经病理和PCR证实为Hp阳性的54例标本,杂交结果显示A2142位点均为野生型(54/54);A2143G突变率为11.11%(6/54),尚未发现A2143C和A2143T的突变;C2182T突变率为12.96%(7/54),尚未发现C2182A和C2182G的突变,其余均为野生型.结论 (1)利用寡核苷酸微阵列技术检测Hp克拉霉素耐药的23S rRNA基因多态性,快速、简便而准确,可以高通量并直接检测胃黏膜而不需进行细菌培养,为根除Hp选择用药提供科学依据,推动个体化治疗方案的实施.(2)本研究没有发现Hp23S rRNA基因2142点突变,A2143G和C2182T突变率分别为11.11%和12.96%.