鳜hepcidin cDNA的分子克隆及序列分析

• 作者: 刘碧莲 劳海华 叶星 白俊杰 简清
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 抗菌肽 hepcidin 鳜 cDNA克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 995-1000
• 页数: 6页
• 分类号: Q959.483
• 字数: 2930字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2006.06.019

摘要

Hepcidin是近年来发现的一类具有独特性质的抗菌肽,根据GenBank中收录的鱼类抗菌肽hepcidin的cDNA 序列设计一对简并引物,用RT-PCR方法从鳜(Siniperca chuatsi)肝脏组织中克隆到hepcidin的cDNA,并构建pMD18-T-hepcidin 载体进行序列测定和分析.结果表明,该cDNA长为381 bp,其中第20～277位是该基因的开放阅读框(ORF),编码86个氨基酸,形成由信号肽(24个残基)、前肽(42个残基)和成熟肽(20个残基)3部分序列组成的前体肽,与已报道的其他鲈形目鱼类hepcidin相比较,核苷酸序列的同源性为72.2%～92.0%,所推导的成熟肽与包括人类在内的其他生物hepcidin成熟肽的同源性在50%～86.4%,都含有8个保守的cys残基,可形成4个链内二硫键.鳜hepcidin cDNA片段的获得为以后的重组表达奠定了实验基础,也为抗菌肽hepcidin家族找到了新的成员.