水稻单核苷酸多态性及其应用

• 作者: 刘传光 张桂权
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 单核苷酸多态性 水稻 基因分型 遗传育种
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 专论与综述
• 页码范围: 737-744
• 页数: 8页
• 分类号: Q94
• 字数: 8119字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2006.06.019

摘要

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)在水稻中数量多,分布密度高,最高SNPs数量可达80 127个,每154个碱基就存在一个SNP,平均SNP频率为0.65%左右.SNPs水稻亚种内品种间也很丰富,亲缘关系近的品种(或品系)间,即使用其他传统的分子标记方法难以找到多态性位点,用SNPs标记法也能找到数量可观的多态性位点.水稻SNP频率在各染色体间存在显著差异,而且在每条染色体上的分布也不均匀,存在明显的SNPs富集区域和稀缺区域.水稻SNPs的发现方法主要有对样本DNA的PCR产物直接测序、从SSR区段检测SNPs,以及从基因组序列和EST数据库直接搜索等.目前已有多种基因分型(genotyping) 技术运用到了水稻SNPs检测,SNPs检测的高度自动化使水稻SNPs基因分型非常方便,SNPs检测还可以转化为CAPS(或dCAPS)标记或等位基因特异的PCR标记进行SNPs的基因分型.单核苷酸多态性在水稻遗传图谱的构建、基因克隆和功能基因组学研究、标记辅助选择育种、遗传资源分类及物种进化等方面的应用具有巨大潜力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张桂权	华南农业大学农学院	60	2015	25.0	44.0
2	刘传光	广东省农业科学院水稻所	34	276	9.0	15.0