珍稀濒危树种毛红椿微卫星DNA分离及SSR反应体系优化

• 作者: 何贵平 刘军 吴天林 孙宗修 陈益泰
• 来源期刊: 中国生物工程杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 毛红椿 微卫星 链亲和素磁珠 SSR反应体系
• 年，卷（期）: 2006,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 50-55
• 页数: 6页
• 分类号: Q94
• 字数: 4129字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8135.2006.12.010

摘要

以江西宜丰种源毛红椿为材料,成功提取其基因组DNA.利用改良的链亲和素磁珠法亲和捕捉出毛红椿基因组微卫星DNA片段,并构建了富含微卫星的基因组文库.从构建的基因组文库中随机挑选了63个单克隆进行测序,其中50个单克隆成功测序,含有微卫星的单克隆有18个,并根据测序结果设计并合成SSR引物18对.利用所合成的引物优化SSR反应体系,对影响SSR反应的各个因子进行了探讨.确定了模板DNA最适浓度为30 ng;dNTP的最适浓度为0.3 mmol/L;0.3 μmol/L是引物在反应体系中的最合适浓度.建立了重复性好、稳定性好的SSR反应体系,为下一步进行毛红椿群体遗传结构和遗传变异研究提供了技术支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴天林	中国林业科学院亚热带林业研究所	12	288	10.0	12.0
2	孙宗修	中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室	54	1941	26.0	43.0
3	陈益泰	中国林业科学院亚热带林业研究所	90	2135	28.0	41.0
4	何贵平	中国林业科学院亚热带林业研究所	62	738	18.0	24.0
5	刘军	中国林业科学院亚热带林业研究所	32	433	13.0	19.0