基于双核酸频率分布特征的细菌亲缘关系定量分析

• 作者: 张宇镭 赵立平
• 来源期刊: 中国微生态学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: Pearson相关性系数 双核酸频率特征向量 基因组特征
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 261-263
• 页数: 3页
• 分类号: R3
• 字数: 2475字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-376X.2006.04.001

摘要

目的采用生物信息学方法定量分析细菌的亲缘关系.方法抽取全基因组核酸序列的双核苷酸频率特征向量,表征数字特征.采用Pearson相关系数分析特征向量之间的距离.结果以119个细菌的全基因组核酸序列为研究对象,两两比对的结果为:越是相近的物种,Pearson相关系数越大,PCC距离越小.结论该方法对细菌亲缘关系的定量描述做了有益的探索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵立平	上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态与生态基因组学实验室	82	1916	26.0	41.0
2	张宇镭	上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态与生态基因组学实验室	4	138	2.0	4.0