人干扰素-λ的二级结构及其B细胞抗原表位的预测

• 作者: 李明才 黄东阳
• 来源期刊: 汕头大学医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 人干扰素-λ 二级结构 B细胞表位 预测
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 201-203
• 页数: 3页
• 分类号: R9
• 字数: 3172字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-4716.2006.04.003

摘要

目的:预测人干扰素(IFN)-λ1、IFN-λ2和IFN-λ3的二级结构特征及其B细胞抗原表位.方法:用Geour-Deleage法预测人IFN-λ1、IFN-λ2和IFN-λ3的二级结构;分别用Hopp-Woods法、Janin法、Zimmerman-Simha法和Bhaskaran-Ponnuswamy法分析各蛋白的亲水性、可及性、极性和柔韧性参数;用Kolaskar-Tongaonkar法预测各蛋白的抗原指数,结合人IFN-λ1、IFN-λ2和IFN-λ3的二级结构特征,综合评价其B细胞抗原表位.结果:人IFN-λ1、IFN-λ2和IFN-λ3的B细胞识别表位可能分别位于其第47～73和154～166、53～75和159～171、53～77和159～171位氨基酸等区域内或附近,被预测的表位均含有β-转角和无规卷曲结构.人IFN-λ1与IFN-λ2,IFN-λ3的二级结构和含有的B细胞优势抗原表位很相似,而人IFN-λ2和IFN-λ3之间的差别非常小.结论:该预测结果将有助于确定人IFN-λ1、IFN-λ2和IFN-λ3的B细胞表位及其生物学活性部位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄东阳	汕头大学医学院变态反应学与炎症学研究所	51	423	10.0	19.0
5	李明才	汕头大学医学院变态反应学与炎症学研究所	29	234	8.0	14.0