共分子伴侣SGTα的二级结构及其B细胞抗原表位预测

• 作者: 李卫东 欧意桃 王丽京 郐一贺 郑凌云 陈佳园 顾取良
• 来源期刊: 广东药学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: SGTα 抗原表位 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 医学研究
• 页码范围: 652-655
• 页数: 4页
• 分类号: R392
• 字数: 2377字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-8783.2015.05.021

摘要

目的 预测共分子伴侣SGTd蛋白的二级结构及其潜在的B细胞抗原表位特性.方法 以NCBI的蛋白质数据库中得到的人SGTα蛋白氨基酸序列为基础,利用PSIPRED、ProtScale、IEDB及Bepipred等生物信息学在线资源分析其二级结构特征及亲水性、表面可及性、柔韧性和抗原指数等,并与其同源物SGTβ进行比对,预测人SGTα蛋白可能的B细胞线性抗原表位.结果 SGTα蛋白的二级结构组成元件主要为α-螺旋和无规卷曲.潜在的B细胞线性抗原表位存在于69～87～207 ～ 211、263～269区段;经与SGTβ蛋白序列比对,SGTα蛋白的N端69～87区段,即KEMPQDLRSPARTPPSEED肽段可能为人SGTα的B细胞抗原优势表位.结论 通过对人SGTα蛋白进行生物信息学分析获得了SGTα蛋白的二级结构和潜在的B细胞抗原表位,为进一步利用合成肽制备抗SGTα的抗体提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王丽京	广东药学院血管生物学研究所	97	294	7.0	12.0
2	郑凌云	广东药学院基础学院	27	88	6.0	8.0
3	李卫东	广东药学院健康学院	36	218	8.0	12.0
4	顾取良	广东药学院基础学院	19	65	4.0	7.0
5	陈佳园	广东药学院血管生物学研究所	4	2	1.0	1.0
6	郐一贺	广东药学院血管生物学研究所	3	1	1.0	1.0
7	欧意桃	广东药学院血管生物学研究所	1	0	0.0	0.0