利用基因组文库加速Xa23基因定位的染色体步移

• 作者: ZHAO Kai-jun 刘丕庆 刘耀光 张群宇 曾超珍 樊颖伦 王春连 章琦 赵开军 陈乐天
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻白叶枯病 抗性基因 基因定位 TAC文库 PAC文库 染色体步移
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 页码范围: 355-360
• 页数: 6页
• 分类号: Q943.2|S511.03
• 字数: 5335字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-7216.2006.04.003

摘要

用距离水稻抗白叶枯病基因Xa23 0.8 cM的EST标记C189,扩增Xa23的近等基因系CBB23的基因组片段(0.8 kb)为探针,筛选水稻明恢63的TAC文库和广陆矮4号的PAC文库,对获得的7个阳性克隆用酶切法和Tail-PCR法进行末端片段分离,获得15个末端片段, 用于感病亲本金刚30和抗病亲本CBB23之间的多态性检测,发现7个末端片段在双亲间有多态性,分别为69B、70N、81N、45B、45N、84N和84B.用这些末端片段作RFLP标记,对金刚30/CBB23的F2群体进行检测和连锁分析,结果表明这些标记与Xa23的遗传距离依次为0.4、0.4、0.4、0.5、0.6、0.6和1.1 cM.虽然69B、70N和81N与Xa23的遗传距离均为0.4 cM,但序列比对揭示69B与70N的物理距离为35 kb,与81N为95 kb,69B距Xa23最近.三者与Xa23的遗传距离虽然相同,但物理距离存在很大差异.这些末端片段标记加密了Xa23基因一侧的遗传图谱,并使其遗传距离缩短到0.4 cM,加速了Xa23的定位进程,为Xa23的分离克隆奠定了重要基础.讨论了这种染色体步移方法的适用条件.