短链蝎毒素BmK38的1H-NMR谱峰归属、二级结构分析及溶液构象

• 来源期刊: 中国科学技术大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 短链蝎毒素 二维核磁共振 序列专一性归属 二级结构 溶液构象
• 年，卷（期）: 2006,（7）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 685-694
• 页数: 10页
• 分类号: Q71
• 字数: 5661字
• 语种: 中文

摘要

BmK38是最近从东亚钳蝎(Buthus martensi Karsch,BmK)中分离纯化得到的一种短链蝎毒素.应用2D-NMR技术研究 BmK38的溶液构象,通过分析其在水溶液中的DQF-COSY、TOCSY和NOESY等1H-NMR谱,识别了 BmK38全部40个氨基酸残基的自旋体系,并通过分析NOESY谱图中daN、dNN、dβN的联系,完成了序列专一性谱峰归属,标定了全部主链质子和绝大部分侧链质子的化学位移.根据谱峰归属的结果和NMR数据分析了 BmK38的二级结构组成并且计算出 BmK38的溶液构象.结构计算的结果与前述二级结构的分析是一致的.结果表明,肽段Gln8～Arg17形成 a 螺旋,而肽段Gly22～Glu29以及Leu32～CYS39构成反平行的β折叠,属于典型的短链蝎毒素的折叠形式.通过与其他 a-KTx短链蝎毒素的结构比较,讨论了 BmK38的结构特异性以及结构功能的相互关系.