应用寡核苷酸芯片进行HLA-DQA1位点基因分型

• 作者: 何群 侯伟建 张玉魁 潘忠诚 王天骄 王彤 王绍成 赵雨杰 马佳明
• 来源期刊: 中国实验血液学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: HLA 基因分型 寡核苷酸芯片
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 分子血液学
• 页码范围: 142-145
• 页数: 4页
• 分类号: R457.11
• 字数: 2915字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-2137.2006.01.032

摘要

为了构建HLA-DQA1位点寡核苷酸分型芯片并籍此建立一种应用于HLA系统基因分型的集成化技术平台,在多态性集中的HLA-DQA1第二外显子区域,自行设计一套寡核苷酸分型探针;采用本实验室自建的方法,制成寡核苷酸芯片.提取的基因组DNA以组间特异性引物,单侧引物荧光标记,行不对称扩增.杂交后扫描检测分析杂交信号,确定HLA等位基因型;分型结果以标准DNA和PCR产物测序检测.结果表明:100例样本芯片分型全部成功,其中50例标准DNA与其模板相符,另50例临床样本中随机选取的10例与其测序结果相符,其中2例分型结果不完全;重复杂交实验中,位点重现率95%.结论:研制的HLA-DQA1等位基因分型芯片,其准确性和重现性理想,且操作简便、快捷,有广泛的应用前景.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘忠诚	中国医科大学生物芯片中心	18	84	5.0	8.0
2	张玉魁	中国医科大学生物芯片中心	14	87	6.0	8.0
3	何群	中国医科大学生物芯片中心	30	114	6.0	8.0
4	马佳明	中国医科大学生物芯片中心	22	175	7.0	11.0
5	王天骄	中国医科大学生物芯片中心	10	26	3.0	4.0
6	王绍成	中国医科大学生物芯片中心	9	22	3.0	4.0
7	王彤	沈阳医学院生化及分子生物学教研室	21	64	6.0	6.0
8	侯伟建	中国医科大学生物芯片中心	8	31	4.0	5.0