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摘要:
目的分析常见皮肤癣菌内转录间隔区(ITS,包括5.8S rDNA)序列,探讨快速、准确鉴定菌种的方法;建立种系发生进化树,了解其亲缘关系.方法用形态学方法对16株皮肤癣菌做初步鉴定,PCR扩增各菌ITS区,扩增产物纯化、DNA测序,做序列比对、分析,建立系统发生树.结果检测了16株菌,包括未见文献报道的猪小孢子菌的ITS全序列,其中11株菌与形态学结果一致,1株菌鉴定为金孢子菌,4株菌通过这两种方法均不能确定.在基于ITS序列构建的N-J系统树中,将皮肤癣菌分成3组,这与依形态学所分的3属不同.结论ITS区序列分析法具有高度的准确性、敏感性,检测范围广泛、快速,可应用于菌种鉴定.但也有局限性,应与形态学鉴定相互补充.ITS区序列为今后更加合理地分类和命名皮肤癣菌提供了参考依据.
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文献信息
篇名 常见皮肤癣菌18S~28S rDNA ITS序列同源性分析
来源期刊 中华微生物学和免疫学杂志 学科 医学
关键词 皮肤癣菌 内转录间隔区(ITS) 鉴定 系统发生树
年,卷(期) 2006,(4) 所属期刊栏目 细菌学
研究方向 页码范围 365-368
页数 4页 分类号 R392
字数 2783字 语种 中文
DOI 10.3760/j:issn:0254-5101.2006.04.017
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刘伟 北京大学第一医院皮肤科 370 2477 19.0 44.0
2 王强 沈阳市第七人民医院皮肤科 70 216 9.0 11.0
3 李若瑜 北京大学第一医院皮肤科 293 2041 19.0 33.0
4 王端礼 北京大学第一医院皮肤科 42 416 11.0 19.0
5 万哲 北京大学第一医院皮肤科 44 366 11.0 16.0
6 张丽娟 北京大学第一医院皮肤科 25 53 4.0 6.0
7 李厚敏 北京大学第一医院皮肤科 19 114 4.0 10.0
8 王小红 北京大学第一医院皮肤科 12 46 4.0 6.0
9 冀朝辉 北京大学医学部基础医学院生物化学与分子生物学系 6 85 6.0 6.0
传播情况
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皮肤癣菌
内转录间隔区(ITS)
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中华微生物学和免疫学杂志
月刊
0254-5101
11-2309/R
大16开
北京市经济技术开发区经海二路38号
2-55
1981
chi
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