白念珠菌酵母相细胞长片段基因表达系列分析文库的构建和初步分析

• 作者: 周村建 李永平 王鲁 邓永键 郝飞 钟白玉
• 来源期刊: 解放军医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 念珠菌,白色 二态性 基因表达谱 长片段基因表达系列分析
• 年，卷（期）: 2006,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 966-968
• 页数: 3页
• 分类号: R3
• 字数: 2749字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0577-7402.2006.10.011

摘要

目的 构建白念珠菌酵母相细胞长片段基因表达系列分析文库并探讨其基因表达特点.方法 采用长片段基因表达系列分析技术(LongSAGE)构建白念珠菌酵母相细胞LongSAGE文库,并从中挑取1 000个阳性克隆进行测序.结果 成功构建了白念珠菌酵母相细胞LongSAGE文库.1 000个测序文件中,共获得标签17 773个,代表单一转录本7 333种,其中单一匹配标签占16.65%,多重匹配标签占6.59%,推测蛋白标签占16.27%,基因组及粘粒等标签占1.64%,新标签为58.86%.标签拷贝数超过35的33个高表达标签中有11个可能属于新的表达序列.结论 LongSAGE是一种能够快速、高通量地研究细胞基因表达谱及其丰度的方法,可发现新的表达序列.