一种基于遗传算法的肽/蛋白质结合模式虚拟筛选建模技术

• 作者: 吴世容 周鹏 李志良 李波 田菲菲
• 来源期刊: 化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 肽/蛋白质结合模式遗传虚拟筛选 定量构效关系 遗传算法 偏最小二乘回归
• 年，卷（期）: 2006,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 691-697
• 页数: 7页
• 分类号: O6
• 字数: 6482字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0567-7351.2006.07.018

摘要

"合理"QSAR模型是指在了解配体与受体相互作用模式的前提下建立定量构效关系,这样避开了传统做法仅仅依靠样本集分子自身信息来构建预测模型的诸多弊端.本文将此思想应用于肽/蛋白质亲和活性的研究当中,借助于遗传算法作为虚拟受体结合靶点及相互作用模式的筛选手段得到了一种新的建模技术:肽/蛋白质结合模式遗传虚拟筛选(genetic virtual screening of combinative mode for peptide/protein,GVSC).该法成功解决了"合理"QSAR研究中的难题,即大多数情况下受体结构未知而难以了解配基与之发生的结合方式.分别使用58个血管紧张素转化酶,18个Camel抗体蛋白cAb-lys3双位点突变残基对GVSC加以检验,其结果表明GVSC能够较好地阐明配基与受体之间的作用机理,并能得到优于传统方法的QSAR模型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李志良	重庆大学化学化工学院	134	1393	19.0	33.0
10	周鹏	重庆大学化学化工学院	50	285	10.0	13.0
14	李波	重庆大学化学化工学院	52	462	13.0	19.0
15	吴世容	重庆大学化学化工学院	17	254	6.0	15.0
16	田菲菲	重庆大学化学化工学院	16	85	6.0	8.0