应用MS-RDA筛选胃癌甲基化差异片段

• 作者: 廖爱军 曾斌 王珣 石巍 苏琦
• 来源期刊: 世界华人消化杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 DNA甲基化 差异片段 MS-RDA
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 365-369
• 页数: 5页
• 分类号: R57
• 字数: 4253字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-3079.2006.04.002

摘要

目的:应用甲基化敏感性代表性差异分析(methylation-sensitive representational difference analysis,MS-RDA)筛选胃癌和正常胃组织间甲基化差异DNA片段.方法:通过MS-RDA筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测序后进行生物信息学分析.结果:获得3个甲基化差异片段,分别为CRS1308,CRS1309,CRS1310序列,其中CRS1309和CRS1310已被GenBank收录,登陆号分别为AY887106和AY887107,CRS1309序列与LOC440683基因第11外显子、LOC440887基因的3'端,DRD5基因启动子和外显子区域均有很高的相似性(分别为98%,99%,94%),CRS1310序列与1999年Minory Toyota在人类结肠癌中分离出的核糖体RNA上的甲基化差异性CpG岛有很高的相似性(98%).结论:胃癌和正常胃组织间DNA甲基化存在差异,MS-RDA可有效分析这两种不同组织间甲基化的差异,筛选出有意义的甲基化差异片段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏琦	南华大学肿瘤研究所	145	1376	21.0	28.0
2	廖爱军	南华大学肿瘤研究所南华大学附属第一医院消化内科	71	326	9.0	14.0
3	曾斌	南华大学附属第一医院消化内科	64	241	7.0	12.0
4	石巍	南华大学附属第一医院消化内科	36	213	8.0	13.0
5	王珣	南华大学附属第一医院消化内科	3	6	2.0	2.0