轮状病毒结构蛋白VP6 HLA-A*0201限制性CTL表位的初步鉴定

• 作者: 吴玉章 唐艳 张小萍 支轶 李晋涛 王靖雪 魏静
• 来源期刊: 第三军医大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 轮状病毒 VP6 HLA-A*0201 CTL 表位
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 499-502
• 页数: 4页
• 分类号: R341|R373.2|R394.2
• 字数: 4460字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-5404.2006.06.003

摘要

目的预测并初步鉴定轮状病毒Wa株结构蛋白VP6 HLA-A*0201限制性CTL表位,为轮状病毒免疫保护机制研究及疫苗的研制奠定基础.方法应用表位亲和力预测软件SYFPEITHI及蛋白酶切位点预测软件PAProc和Fragpredict相结合预测VP6 HLA-A*0201限制性CTL表位;用分子模拟对候选肽作进一步筛选;标准Fmoc方案合成候选肽,RP-HPLC纯化、分析,质谱进行鉴定;最后用T2细胞株测定候选肽与HLA-A*0201分子的亲和力及稳定性.结果结合SYFPEITHI、蛋白酶切位点预测结果及分子模建结果,选择分值最高同时在C-末端含有蛋白酶切位点的4条肽作为候选表位肽;标准Fmoc方案合成的各肽纯度均大于95%,质谱检测结果表明,各肽的相对分子质量与理论值基本一致;在候选的4条表位肽中,TLLANVTAV(340-348)和VLADANETL(333-341)与HLA-A*0201呈高亲和力结合,荧光系数(flurorescene index,FI)分别为2.66和2.64,同时肽-HLA-A*0201复合物半数解离时间(dissociation complex50,DC50)均大于8 h.结论TLLANVTAV(340-348)和VLADANETL(333-341)为潜在的HLA-A*0201限制性CTL表位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李晋涛	第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所	51	189	8.0	11.0
2	王靖雪	第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所	17	70	4.0	8.0
3	魏静	第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所	10	28	3.0	5.0
4	支轶	第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所	11	43	4.0	6.0
5	唐艳	第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所	24	114	7.0	9.0
6	张小萍	第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所	7	12	2.0	3.0