猪传染性胃肠炎病毒SCY株3'端8.5kb片段的克隆及序列特征分析

• 作者: 孙志勇 宋振辉 徐志文 杨丽 殷华平 王小玉 郭万柱 陈进会
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪传染性胃肠炎病毒(TGEV) M基因 S基因 N基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 66-71
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 3722字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2007.01.012

摘要

根据GenBank的核酸序列,设计6对引物自TGEV SCY株中分别扩增了长为1.5 kb、2.0 kb、1.1 kb、1.4 kb、1.4 kb、1.3 kb的6个片段,经克隆测序拼接后获得8 495 bp的TGEV部分序列.根据与其他TGEV和冠状病毒的序列和结构特征比较表明,该段序列克隆了除TGEV聚合酶基因以外的S、M、N、E、NSP3a、NSP3b、ORF7共7个基因的核酸序列;根据S、M、N基因的序列构建了系统进化树,分析表明TGEV-SCY株与TS、HN2002、TO14、pudue等毒株亲缘关系较近;密码子偏爱性分析结果认为TGEV在对密码子的使用上存在轻微的偏向性,个别氨基酸偏向于选择以A和T结尾的密码子.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭万柱	四川农业大学动物生物技术中心	166	1465	21.0	28.0
2	徐志文	四川农业大学动物生物技术中心	184	909	15.0	20.0
3	王小玉	四川农业大学动物生物技术中心	41	312	9.0	15.0
4	宋振辉	四川农业大学动物生物技术中心	13	73	6.0	8.0
5	殷华平	四川农业大学动物生物技术中心	12	129	8.0	11.0
6	杨丽	四川农业大学动物科技学院	6	26	3.0	5.0
7	孙志勇	四川农业大学动物生物技术中心	6	20	3.0	4.0
8	陈进会		1	0	0.0	0.0