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费氏中华根瘤菌HN01pmrA所在基因簇的结构分析
费氏中华根瘤菌HN01pmrA所在基因簇的结构分析
作者:
曹永强
梁善范
武波
陆祖军
陈钢
隆文杰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
费氏中华根瘤菌
基因文库
结构域分析
启动子
摘要:
经原位杂交,从费氏中华根瘤菌HN01基因组文库中钓出含有pmrA基因的阳性克隆pGXHN300,对其进行亚克隆测序得到pmrA两翼6.8 kb的DNA序列.生物信息学分析显示,该序列包括6个完整的ORF和1个不完整ORF.pmrA所在的基因簇含有4个ORF:ORFa、 ORFb、ORFc、ORFd(pmrA).其中,ORFa与Rhizobium etli的cysG(CAA04958.1)在氨基酸水平一致性为79%,相似性为87%.对ORFc序列分析发现与亚硫酸及亚硝酸还原相关的保守结构域.通过融合PCR方法,将两个潜在的启动子序列分别连在gus上游,以pTR102为载体导入HN01中.在完全培养基YMA上两个启动子均不表达,在以硝酸钠为氮源,亚硫酸钠、硫酸钠或甲硫氨酸分别为硫源的MM培养基上生长均表达出GUS活性,表明这两个潜在的启动子与硫、氮代谢相关.
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文献信息
篇名
费氏中华根瘤菌HN01pmrA所在基因簇的结构分析
来源期刊
广西农业生物科学
学科
生物学
关键词
费氏中华根瘤菌
基因文库
结构域分析
启动子
年,卷(期)
2007,(1)
所属期刊栏目
生物技术专栏
研究方向
页码范围
14-19
页数
6页
分类号
Q939.96
字数
3564字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
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姓名
单位
发文数
被引次数
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1
陈钢
广西大学生命科学与技术学院
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隆文杰
广西大学生命科学与技术学院
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陆祖军
广西大学生命科学与技术学院
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曹永强
广西大学生命科学与技术学院
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广西大学生命科学与技术学院
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2007(1)
引证文献(1)
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节点文献
费氏中华根瘤菌
基因文库
结构域分析
启动子
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广西农业生物科学
主办单位:
出版周期:
季刊
ISSN:
CN:
开本:
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
语种:
chi
出版文献量(篇)
1115
总下载数(次)
1
总被引数(次)
10079
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
国家重点基础研究发展计划(973计划)
英文译名:
National Basic Research Program of China
官方网址:
http://www.973.gov.cn/
项目类型:
学科类型:
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