斑茅两个看家基因片段的克隆及其在基因芯片中的应用

• 作者: 张木清 张积森 李伟 阙友雄 阮妙鸿 陈如凯
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑茅 看家基因 基因芯片 PEG
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 277-283
• 页数: 7页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 4124字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2007.04.001

摘要

根据已发表的同源基因序列,利用RT-PCR技术分离了斑茅(Erianthus arundinaceus)的GAPDH和APRT两个看家基因片段,用它们作为cDNA芯片阳性参照,以未经聚乙二醇(PEG)胁迫处理的斑茅叶片为对照,和PEG胁迫的4组材料同cDNA芯片进行杂交分析.杂交结果显示,GAPDH杂交的Cy5与Cy3平均信噪比(Signal/Noise,S/N)分别为56.12和60.8,APRT杂交的Cy5与Cy3平均信噪比分别为51.06和47.25,信噪比均很高;同时两个看家基因的杂交都显示出极强的信号,其中GAPDH的杂交信号值大于10 000,APRT也在8 000以上,杂交结果可靠.分析了PEG胁迫4个时段BADH与两个看家基因的表达,BADH的表达有明显变化,而看家基因表达均较稳定.上述结果表明所克隆的两个看家基因在斑茅中表达量高,且PEG胁迫下表达较为稳定,是基因芯片理想的阳性参照.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张木清	福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室	64	1517	23.0	37.0
2	张积森	福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室	9	144	7.0	9.0
6	李伟	福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室	7	54	4.0	7.0
7	阙友雄	福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室	41	502	13.0	21.0
8	阮妙鸿	福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室	12	174	9.0	12.0