用基因芯片技术分析铝胁迫下小麦的基因表达谱

• 作者: Guihua Bai Patricia Ayoubi 李荣华 郭培国
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 小麦 基因芯片 耐铝性 表达谱
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 581-586
• 页数: 6页
• 分类号: Q789|Q945.78
• 字数: 1154字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2007.04.009

摘要

目的:采用基因表达谱分析方法,探讨小麦耐铝的分子机理.方法:利用抑制消减杂交(SSH)技术,以小麦的铝敏感品种Chisholm及其耐铝近等基因系Chisholm-T(其耐铝性来自小麦品种Atlas 66)的根尖为材料,构建了2个铝胁迫后的SSH cDNA文库,共含有1 628个表达序列标签(EST),利用这些EST制作了小麦根系的cDNA基因芯片.以cDNA基因芯片为平台,在铝胁迫后6 h、1 d、3 d和7 d,分别比较Chisholm和Chisholm-T之间的基因表达谱差异.结果:在各个时间点,耐铝和不耐铝小麦材料之间约有5%的EST表现出差异表达.对所有差异表达的EST进行测序分析,序列数据经PipeOnline 2.0进行毗连序列群(contig)拼接,发现只有8.3%的重复序列.结论:SSH是一种非常有效的差减和均一化的建库方法.对有功能注释的差异表达基因进行功能分类分析,表明这些基因参与了植物体内的电子传递、信号传导、植物保护和次生物质的代谢活动.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭培国	广州大学生命科学学院	46	479	12.0	20.0
2	李荣华	广州大学生命科学学院	39	412	10.0	19.0