MLVA和Spoligotyping用于西藏地区216株结核分枝杆菌临床分离株的基因分型研究

• 作者: Christine Pourcel 万康林 吕冰 尼玛彭多 张媛媛 朗珍 杨敏 石荔 范昕建 董海燕 蒋毅 魏淑贞
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 结核分枝杆菌 间隔区寡核苷酸分型 多位点可变数量串联重复序列分析 基因分型
• 年，卷（期）: 2007,（8）
• 所属期刊栏目: 细菌学
• 页码范围: 711-718
• 页数: 8页
• 分类号: R3
• 字数: 4079字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j.issn:0254-5101.2007.08.010

摘要

目的 评价间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及多位点可变数量串联重复序列分析(MLVA)两种分型方法在西藏地区结核病分子流行病学中的应用.方法 收集西藏地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)临床分离株,应用Spoligotyping及MLVA两种分型方法进行比较分析.结果 共在西藏地区收集剑216株结核分枝杆菌临床分离株,采用Spoligotyping分型方法,216株菌可分为3个基因群13种基因型,其中最大的1个基因群即北京家族(Beijing family)含有195株菌,占90.28%.北京家族菌株中,有BCG接种史者占45.64%(89/195),无BCG接种史者占54.36%(106/1195),两者间的差异无统计学意义(χ2=0.059,P＞0.05).采用MLVA分型方法,216株菌可分成19个基因群108种基因型,其中80种基因型只有1株菌,占37.03%(80/216),另有136株菌表现出28种基因型,成簇数为28,占62.96%(136/216).在20个VNTR位点的等位基因多态性发现Miru31位点的多态性最高,多态性指数(h)达到0.77,而Mtub29、Mtub12位点的多态性较差,都低于0.05.其中Mtub02位点可鉴别北京家族和非北京家族,它鉴别的北京家族与Spoligotyping鉴别的北京家族符合率达到100%.结论 西藏地区结核分枝杆菌具有明显的接引多态性,其主要流行型为北京家族.北京家族菌株与BCG接种无相关性.应用Spoligotyping和MLVA两种分型方法进行结核病流行病学研究,将提高结核病的流行病学调查和病原学监测效果.