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摘要:
目的 了解结核分枝杆菌北京临床分离株的基因分型种类和特征,为结核病防治研究提供基础科学依据.评价两种分型方法 在北京地区结核病分子流行病学中的应用.方法 收集北京市结核分枝杆菌临床分离株,应用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)二种分型方法进行基因分型,结果 聚类分析采用BioNumerics(Version 5.0)软件.结果 共在北京地区收集到220株结核分枝杆菌临床分离株.采用Spoligotyping分型方法,220株菌可分为2个基因群,即北京家族(Beijing family)和非北京家族(non-Beijing family),20种基因型.其中北京家族含有202株菌,占91.82%.北京家族菌株中,典型北京家族菌株占95.05%(192/202),非典型北京家族占4.95%(10/202).北京家族菌株的耐药率为22.55%(22/98),非北京家族菌株的耐药率为16.67%(1/6),两者间的差异无统计学意义(fisher analysis,P=0.5835>0.05).采用MLVA分型方法,202株菌可分成5个基因群59种基因型,主要为Beijing family、China2 和China3,分别占91.37%、2.73%和4.55%.结论 北京地区结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,其主要流行型为北京家族.北京家族菌株与耐药性无明显相关性.
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Spoligotyping对广西地区208株结核分枝杆菌临床分离株的基因分型
结核分枝杆菌
间隔区寡核苷酸分型
基因分型
北京基因型
耐药
牛分枝杆菌广西分离株ESAT-6基因鉴定及遗传进化分析
牛分枝杆菌
广西分离株
ESAT-6基因
PCR
同源性
内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 220株结核分枝杆菌北京临床分离株的基因分型研究
来源期刊 中国人兽共患病学报 学科 医学
关键词 结核分枝杆菌 间隔区寡核苷酸分型 多位点可变数量串联重复序列分析 基因分型
年,卷(期) 2008,(5) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 412-417
页数 6页 分类号 R378.91
字数 3293字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1002-2694.2008.05.006
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研究主题发展历程
节点文献
结核分枝杆菌
间隔区寡核苷酸分型
多位点可变数量串联重复序列分析
基因分型
研究起点
研究来源
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相关学者/机构
期刊影响力
中国人兽共患病学报
月刊
1002-2694
35-1284/R
大16开
福建省福州市津泰路76号
34-46
1985
chi
出版文献量(篇)
6893
总下载数(次)
10
总被引数(次)
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相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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