非连续分子动力学模拟方法及其在大分子研究中的应用

• 作者: 丁建东 罗钟琳 闫策
• 来源期刊: 功能高分子学报
• 学科: 工学
• 关键词: 非连续分子动力学 计算机模拟 蛋白质折叠 大分子构象 多链体系
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 443-456
• 页数: 14页
• 分类号: TQ172.79
• 字数: 10789字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-9357.2007.04.020

摘要

计算机模拟技术已成为大分子构象等基础研究的一种重要手段.非连续分子动力学模拟(DMD)与传统的分子动力学模拟(MD)方法有所不同,基于不连续势能和相关的模拟编程方法,运行速度大大提高.本文讨论了DMD方法的特点,总结了DMD方法的应用,重点以蛋白质折叠为例介绍了如何使用DMD方法,最后对DMD方法的发展前景进行了展望.