基于网格计算思想,提出集成远程高性能计算硬件、软件资源和计算前、后处理功能的高性能计算化学应用模型,并基于此模型开发了GridMol系统.GridMol采用Browser/Server结构设计,服务器端通过网格中间件提交高性能计算作业高效利用网格中的各种硬件、软件资源,浏览器端GridMol提供图形化的计算化学前、后处理功能,如蛋白质可视化和分子建模处理.GridMol基于Java和Javaa 3D API设计实现,系统具有跨平台和网络运行等优点,目前GridMol已集成在中国国家网格(CNGrid)平台上.