广东人禽流感H5N1毒株M基因特性、进化和变异

• 作者: 俞守义 方苓 李晖 柯昌文 邹丽容 陈秋霞 黄平
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 人禽流感 H5N1毒株 M基因 特性 进化 变异
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 专题报道 流感病毒研究
• 页码范围: 371-376
• 页数: 6页
• 分类号: R373.1|R392
• 字数: 3996字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2007.05.007

摘要

通过对人禽流感H5N1毒株M基因序列的变异分析,揭示毒株M基因特征与进化.检测广东地区人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株M基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析.结果发现,1997～2006年53株毒株M1基因和51株毒株M2核苷酸序列同源性均分成两组,1997年毒株为第一组(GⅠ),2003～2006年香港、越南、泰国、印尼、中国大陆、土耳其、伊拉克、阿塞拜疆、埃及毒株为第二组(GⅡ).M1基因20个氨基酸位点置换,占7.94%(20/252),其中2003～2006年毒株M1基因有9个氨基酸位点不同于1997年毒株;M2基因22个氨基酸置换,占22.7%,其中2003～2006年毒株M2基因有4个氨基酸不同于1997年毒株.M2基因Ks值为26.8×10-6～42.6×10-6 Nt/d,Ka值为4.39×10-6～6.98×10-6 Nt/d;而M1基因的同义突变速度均远高于错义突变速度,显示M1基因受到机体免疫压力较小;检验发现M1基因进化存在负选择性压力.2003～2006年毒株M1基因通过氨基酸S224N置换,增加一个糖基化位点NSS224-226;而来自印尼的8株毒株M2基因发生C50F置换,引起蛋白二级结构改变.1997年中国香港人禽流感毒株自当时出现后,便未在以后人禽流感疫情中出现.2003～2006年毒株M1基因增加糖基化位点NSS224-226,可能与毒株致病性有关.人禽流感H5N1毒株M基因在自然界变异频繁,可能影响H5N1毒株的人-人传播能力.