H5N1亚型禽流感病毒新疆株HA基因的克隆及序列分析

• 作者: 崔尚金 巴格德力 巴特力 成进 李曦 汪萍 沙依兰古丽 符子华
• 来源期刊: 中国兽医杂志
• 关键词: 禽流感病毒 H5N1亚型 HA基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 调查研究
• 页码范围: 3-5
• 页数: 3页
• 分类号: Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0529-6005.2008.03.001

摘要

参照已发表的H5N1亚型禽流感的HA基因序列,设计了1对引物,对禽流感病毒新疆株A/Duck/XJ/3(H5N1)、A/Duck/XJ/4(H5N1)、A/CH/XJ/5(H5N1)、A/Goose/XJ/10(H5N1)和A/Duck/XJ/11(H5N1)进行RT-PCR扩增和克隆,获得了5个毒株的HA全长核苷酸序列,分别为1 779 bp、1 774 bp、1 776 bp、1 758 bp和1 740 bp序列分析表明,在HA切割位点处均有多个连续的碱性氨基酸(-R-E-R-R-R-K-K-R-)插入,具有高致病性禽流感病毒的特征.同源性分析表明,新疆分离株之间的核甘酸同源性在96.9%～98.8%;与来自青海湖斑头雁、广西天鹅、香港白鹭和台湾鸽等不同野禽毒株同源性为95.7%～100%;与来自香港、越南、浙江的人源禽流感毒株的同源性为95.2%～98.2%.