我国水稻主栽品种SSR多样性的比较分析

• 作者: 余汉勇 华蕾 徐群 汤圣祥 王一平 袁筱萍 魏兴华
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 主栽品种 微卫星标记 遗传多样性 分子方差分析
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 页码范围: 150-154
• 页数: 5页
• 分类号: Q943|S511.03
• 字数: 3631字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-7216.2007.02.007

摘要

采用40个SSR标记,比较分析了151份20世纪50年代(78份)和近10年(73份)我围常规稻主栽品种的遗传差异,发现有39个标记具有多态性,多态性位点共检测到213个等位基因,每个位点2～11个,平均5.5个;平均Nei基因多样性指数(He)为0.649,范围在0.309(RM174)～0.869(RM418).籼粳亚种间SSR多样性差异明显,籼稻平均等位基因数(Na)和Nei基因多样性指数(Na=4.4,He=0.458)均高于粳稻品种(Na=4.0,He=0.395).比较了78份20世纪50年代与73份近10年水稻主栽品种的遗传多样性,籼、粳亚种表现出相近的变化趋势,即Nei多样性指数和等位基因数20世纪50年代主栽品种高于近10年的.虽然Nei基因多样性指数的变化并不显著(籼稻:z=1.471,P=0.141;粳稻:z=1.932,P=0.053),但等位基因数目的变化达到显著水平(籼稻:z=2.677,P=0.007;粳稻:z=3.441,P=0.001).分子方差分析(AMOVA)表明,遗传变异绝大部分存在于两时期内,尽管时期间平均贡献的遗传变异仅占1.9%,但仍然达到5%的显著水平;籼、粳亚种两时期间平均贡献的遗传变异高于整个分析样本,分别为5.0%和8.2%;籼、粳亚种不同位点的遗传分化程度也各不相同,籼稻和粳稻品种分别有13个(占33.3%)和11个(占28.2%)SSR位点的等位基因在两时期间差异显著,而其余位点的遗传变异则是因时期内品种间的差异引起的.研究表明近10年我国常规稻主栽品种丢失了一部分等位基因,水稻育种仍应加强更广泛的种质亲本的选择.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汤圣祥	中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室	29	982	17.0	29.0
2	余汉勇	中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室	31	781	16.0	27.0
3	王一平	中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室	30	706	14.0	26.0
4	袁筱萍	中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室	27	561	13.0	23.0
5	徐群	中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室	13	275	7.0	13.0
6	华蕾	中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室	1	105	1.0	1.0