新城疫病毒TL1株P基因的克隆及序列分析

• 作者: 任林柱 张辉 李晓艳 王兴龙 王学理 闫广谋
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 医学
• 关键词: 新城疫病毒 P基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 32-34
• 页数: 3页
• 分类号: R3
• 字数: 2939字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-944X.2007.03.015

摘要

根据GenBank登陆的新城疫病毒P基因序列,设计了一对引物,用RT-pCR技术对新城疫病毒内蒙古分离株TL1的P基因进行了扩增.将扩增产物提纯后克隆入pGEM-T easy载体,通过酶切、PCR和测序验证克隆正确.测序拼接得出P基因的序列长度为1248 bp,该基因的ORF总长为1188 bp,编码395个氨基酸.与GenBank下载的12株参考毒株比较P基因编码区全核苷酸序列和氨基酸序列,发现TL1株与鹅源新城疫NA-1株核苷酸的同源性为99.8%,氨基酸的同源性为99.2%;与鹅源新城疫ZJ1株核苷酸的同源性为96.1%,氨基酸的同源性为95.5%,说明TL1株和与鹅源新城疫NA-1株、ZJ1株的同源性极高,它们三者亲缘关系较近,同属于基因Ⅶ型新城疫病毒.而与传统疫苗株LaSota核苷酸的同源性为83.4%,氨基酸的同源性81.8%,说明该毒株相对于经典的NDV在P基因上已发生了较大的变异.