斑点叉尾(鮰)趋化因子SCYA126基因及其可变剪接

• 作者: 刘占江 李家乐 汪桂玲 鲍宝龙
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑点叉尾鮰 趋化因子 SCYA126 RNA可变剪接
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.499
• 字数: 3875字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2007.01.001

摘要

通过探针杂交筛选斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)BAC基因组文库,利用引物步移的方法对阳性克隆BAC047_K12进行序列测定,得到2 815 bp的SCYA126基因组序列.序列分析表明,SCYA126基因由2个外显子和1个内含子组成;外显子拼接的序列与SCYA126 cDNA序列完全一致,编码92个氨基酸,在N端含有2个相邻的半胱氨酸(CC)和2个不相邻的半胱氨酸,为典型的CC趋化因子亚家族成员;其上游调控序列包含TATA框启动子序列和一些与免疫相关的转录因子结合位点.另外,根据与GenBank接收号为BM029630的EST序列的比较分析,发现SCYA126基因组中的内含子没有被剪接,导致翻译后可能产生N端部分缺失的SCYA126蛋白.在胰脏和肝脏中确认了高表达的包含内含子的mRNA的存在,而且其表达量要明显高于正常剪接的SCYA126 mRNA.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李家乐	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	84	1817	27.0	38.0
2	汪桂玲	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	20	306	11.0	17.0
3	鲍宝龙	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	16	228	10.0	15.0