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摘要:
目的:利用生物芯片技术分析6种不同器官肿瘤细胞中microRNA(miRNA)的表达差异.方法:将210个与已知人类和小鼠miRNA互补的序列(206个miRNA,4个阳性对照)作为探针,点于玻片上制备寡核苷酸芯片.提取肿瘤细胞HeLa(人宫颈癌上皮细胞)、MCF-7(人乳腺癌细胞)、A549(人肺腺癌细胞)、HT-29(人结肠腺癌细胞)、ES-2(人卵巢透明细胞癌)、K562(人慢性髓细胞性白血病细胞)的miRNA,荧光染料Cy3标记,并与制备好的芯片杂交;用ScanArrayTM Express1.0扫描仪扫描荧光信号,采用ScanArray3.0和Cluster3.0软件分析处理扫描结果;Northern blotting和RT-PCR方法对芯片检测结果进行验证.结果:在6种不同器官肿瘤细胞中,检测到115种miRNA存在差异,91种miRNA没有明显差异;其中,miR-21在6种肿瘤细胞表达水平均较高,miR一125b表达水平均较低,let-7不同亚型在6种细胞系中表达水平较低;miR-17-5p和miR一20a呈集簇表达,在卵巢肿瘤ES-2细胞中的表达水平高于其他细胞,乳腺肿瘤细胞系MCF-7和宫颈癌细胞系HeLa的miRNA表达谱聚为一类.Northern blotting检测到miR-17-5p及其前体在K562细胞中均见表达,A549和ES-2细胞中只见较弱的前体表达,MCF-7、HeLa和HT-29中可见明显的前体和较弱的成熟miRNA的表达.RT-PCR检测到miR-17-5p前体在K562细胞中表达水平高于其他几种细胞,在ES-2细胞中的表达量低于K562细胞,同时高于另外4种细胞;miR-21在6种肿瘤细胞中表达水平均较高,在A549细胞中表达最高.结论:应用生物芯片技术检测肿瘤细胞中miRNA的表达差异为进一步探索miRNA与肿瘤间的关系奠定基础.
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文献信息
篇名 MicroRNA在6种肿瘤细胞中的表达差异
来源期刊 中国肿瘤生物治疗杂志 学科 医学
关键词 microRNA 肿瘤细胞 寡核苷酸芯片 表达差异
年,卷(期) 2007,(3) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 254-258
页数 5页 分类号 R730.2
字数 3808字 语种 中文
DOI 10.3872/j.issn.1007-385X.2007.03.011
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李欣 天津医科大学天津市生命科学中心 58 291 10.0 13.0
2 刘民 天津医科大学天津市生命科学中心 41 187 8.0 10.0
3 汤华 天津医科大学天津市生命科学中心 69 351 10.0 15.0
4 马卓娅 天津医科大学天津市生命科学中心 3 22 2.0 3.0
5 王晶 天津医科大学天津市生命科学中心 17 74 6.0 8.0
6 吴海东 天津医科大学天津市生命科学中心 5 28 3.0 5.0
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研究主题发展历程
节点文献
microRNA
肿瘤细胞
寡核苷酸芯片
表达差异
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国肿瘤生物治疗杂志
双月刊
1007-385X
31-1725/R
大16开
上海市杨浦区翔殷路800号
4-576
1994
chi
出版文献量(篇)
3206
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6
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