腐烂茎线虫不同地理种群ITS区序列比对及系统发育

• 作者: 季镭 杨秀丽 林茂松 王金成 黄国明
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 腐烂茎线虫 鳞球茎茎线虫 食菌茎线虫 ITS(Internal transcribed spacer) 系统发育关系
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 页码范围: 79-83,98
• 页数: 6页
• 分类号: S435.621.2+9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1573.2007.05.020

摘要

为弄清我国腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)不同地理种群ITS(Internal transcribed spacer)区之间的碱基差异及系统发育关系,本研究通过网络软件Clustalw1.83对腐烂茎线虫的核糖体ITS区核酸序列进行了比对,结果发现腐烂茎线虫的8个种群中,DEll、DEly、DEAY987007三个种群(Ⅰ组)内部之间的碱基差异在1%以内,其它的5个种群(Ⅱ组)之间的差异为0～1%,而Ⅰ组与Ⅱ组种群之间的差异达到了15%(根据ITS1+5.8s+ITS2序列)或20%(根据ITS1+ITS2序列).这说明我国腐烂茎线虫很可能是1个复合种.根据ITS区核酸序列构建的系统发育图同样显示,我国腐烂茎线虫的7个地理种群明显分为2个分支A和B.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄国明		47	295	11.0	14.0
2	林茂松	南京农业大学植病系	34	653	16.0	25.0
3	王金成		31	234	10.0	14.0
4	季镭	南京农业大学植病系	4	87	4.0	4.0
5	杨秀丽		9	88	5.0	9.0