不同地区松茸ITS序列分析及系统发育研究

• 作者: 刘磊 周广麒 李长田 金华
• 来源期刊: 中国食用菌
• 关键词: 松茸 遗传多样性 ITS序列 鉴定
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 生理生化
• 页码范围: 45-48
• 分类号: S646.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-8310.2011.06.015

摘要

对吉林省延吉市和云南省昆明市松茸子实体的ITS序列进行遗传多样性研究.提取两个地区松茸子实体的基因组DNA,应用特异引物对其ITS序列进行PCR扩增及测序,并对云南省昆明市松茸样品进行克隆及测序.之后从GenBank上获取5个地区7条松茸ITS序列,并利用MEGA、BLAST、DNAMAN和ClustaⅨ软件进行对比分析和构建系统发育树.对云南松茸样品克隆发现,ITS序列中有A与G、T与C的颠换,并插入1个碱基T.序列对比发现,松茸ITS序列长度在600 bp～604 bp范围内,G+C含量在43.0％～44.2％之间,共有41个变异位点,ITS2变异位点数要多于ITS1的变异位点数.同时,多个位点存在着转换、颠换、插入和缺失,表明不同产地松茸ITS序列在进化过程中存在差异,为真菌分类、鉴定等研究提供了重要的资料和依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	金华		87	424	9.0	17.0
2	李长田	吉林农业大学中药材学院	53	200	8.0	12.0
3	周广麒		32	88	6.0	8.0
4	刘磊		2	18	2.0	2.0