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链霉菌看家基因引物的设计与验证
链霉菌看家基因引物的设计与验证
作者:
郭银平
黄英
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
看家基因
引物
链霉菌
扩增
测序
高(G+C)mol%
摘要:
看家基因的扩增与测序是进行多基因系统进化分析首先需要解决的问题.针对链霉菌这一群高(G+C)mol%革兰氏阳性细菌,选定4个看家基因:atpD、recA、rpoB和trpB,利用NCBI数据库中已有的2个链霉菌和3个分枝杆菌的全基因组序列,以及另两个链霉菌的recA基因序列,通过软件分析设计了各基因的扩增和测序引物,并优化了扩增反应条件.从所试验的55株链霉菌中,均特异地扩增出了上述4个基因的片段,并成功进行了序列测定,验证了所设计引物的实用性.所归纳的引物设计方法可用于高(G+C)mol%革兰氏阳性细菌的其它看家基因,以促进多基因系统进化研究的开展.
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序列分析
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链霉菌
次级代谢产物
抗生素生物合成基因簇
调控基因
螺旋链霉菌U-1941中PKSⅡ型基因在淡青链霉菌tcmK变异株中的克隆(Ⅰ)
基因表达
PKS
Ⅱ
螺旋链霉菌
淡青链霉菌tcmK变异株
内容分析
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引文网络
相关学者/机构
相关基金
期刊文献
内容分析
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相关文献总数
(/次)
(/年)
文献信息
篇名
链霉菌看家基因引物的设计与验证
来源期刊
微生物学报
学科
生物学
关键词
看家基因
引物
链霉菌
扩增
测序
高(G+C)mol%
年,卷(期)
2007,(6)
所属期刊栏目
研究简报
研究方向
页码范围
1080-1083
页数
4页
分类号
Q939
字数
3983字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:0001-6209.2007.06.026
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
黄英
中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室
55
854
18.0
26.0
2
郭银平
中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室
1
15
1.0
1.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(10)
节点文献
引证文献
(15)
同被引文献
(1)
二级引证文献
(12)
1992(1)
参考文献(1)
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1996(1)
参考文献(1)
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1999(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2001(2)
参考文献(2)
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2002(1)
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参考文献(1)
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2005(1)
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参考文献(1)
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参考文献(0)
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引证文献(0)
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引证文献(1)
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2018(2)
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链霉菌
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
微生物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0001-6209
CN:
11-1995/Q
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号中科院微生物所内
邮发代号:
2-504
创刊时间:
1953
语种:
chi
出版文献量(篇)
4459
总下载数(次)
15
总被引数(次)
53416
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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