猪传染性胃肠炎病毒纤突蛋白全基因的克隆与序列分析

• 作者: 何晓宁 吕宁 张涌 彭树英
• 来源期刊: 西北农林科技大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 猪传染性胃肠炎冠状病毒 纤突蛋白基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（7）
• 所属期刊栏目: 动物科学与动物医学
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S858.282.65+9.6
• 字数: 3642字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1671-9387.2007.07.001

摘要

采用RT-PCR和重组PCR扩增猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus of swine,TGEV)TSX毒株纤突蛋白(spike protein,S)基因全长cDNA序列,分离纯化PCR产物,连接到pGEM-T载体,转化大肠杆菌DH5α,筛选阳性克隆pGEM-S,并对其进行酶切鉴定和测序,对测序结果及推导氨基酸序列进行同源性分析.结果表明,S基因全长为4 350 bp(GenBank登录号DQ001167),编码1 449个氨基酸,N端前16个氨基酸为推测的信号肽序列,其后1 433个氨基酸构成成熟蛋白;与GenBank中已发表的9个TGEV毒株S基因进行比较,核苷酸序列同源性为95%～98%,推导的氨基酸序列同源性为95%～98%.基于S基因及其推导氨基酸序列的聚类分析表明,TSX株与Miller、T014、TS和HN2002株亲缘关系较近.S基因变异是由于碱基突变造成10处氨基酸发生改变,但主要抗原部位未发生任何变异,为进一步研制猪传染性胃肠炎基因疫苗提供了良好的候选基因.