大豆吡哆醇生物合成蛋白基因(PDX)的电子克隆和进化分析

• 作者: 孟宪萍 李蕊 李雅轩 胡英考 蔡民华
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 电子克隆 EST数据库 RT-PCR 基因组PCR 大豆 吡哆醇生物合成蛋白
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 页码范围: 64-68
• 页数: 5页
• 分类号: S565.1
• 字数: 3524字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-7091.2007.01.015

摘要

电子克隆(In silico cloning)是随着基因组计划和EST计划实施而发展起来的利用生物信息学手段进行基因克隆的新方法.根据物种间同源基因相对保守的特点,以拟南芥(Arabidopsis thaliana)吡哆醇生物合成蛋白cDNA序列为信息探针,对大豆(Glycine max)EST数据库进行同源搜索和序列拼接,获得了1 280 bp长的大豆吡哆醇生物合成蛋白的基因序列(GenBank登陆号为DQ139265).经过RT-PCR扩增、基因组PCR扩增、分子克隆和序列分析验证,结果表明与电子克隆序列完全一致.该基因具有完整的开放阅读框架(ORF,20～955 bp),编码311个氨基酸.通过与水稻、日本百脉根、烟草、截形苜蓿等物种的吡哆醇生物合成蛋白序列比对,发现该基因具有高度的保守性.表明根据物种间同源基因序列,对跨物种间EST数据库进行同源检索、筛选、拼接,是克隆基因的有效途径.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡英考	首都师范大学生命科学学院	41	609	15.0	23.0
2	李雅轩	首都师范大学生命科学学院	43	499	14.0	20.0
3	蔡民华	首都师范大学生命科学学院	31	341	11.0	17.0
4	李蕊	首都师范大学生命科学学院	7	78	4.0	7.0
5	孟宪萍	首都师范大学生命科学学院	5	40	4.0	5.0