HLAⅠ、Ⅱ类抗原的组织配型基因芯片的建立及应用

• 作者: 孙蓓 张明新 张瑞 梁东春 郭刚
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: HLAⅠ、Ⅱ类抗原 基因芯片 中分辨度 分型
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 免疫检测
• 页码范围: 74-79
• 页数: 6页
• 分类号: R3
• 字数: 5644字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2007.01.021

摘要

目的 应用基因芯片技术进行北方汉族人群HLAⅠ、Ⅱ类抗原中分辨度分型研究,建立稳定的HLA检测芯片.方法 采用寡核苷酸芯片分型方法,选择了中国人群基因频率较高的等位基因,同时考虑遗传的连锁不平衡,根据HLA-A、HLA-B、HLA-DR、HLA-DQB、HLA-DQA不同基因亚型的独特序列,完成了探针的设计与筛选,共设计了213条探针(HLA-A 56条,HLA-B 66条,HLA-DQA 22条,HLA-DQB 38条,HLA-DR 31条)制成基因分型芯片.采用带荧光标记的引物,用合适的PCR方法扩增HLAⅠ、Ⅱ类抗原上的多态性区域,产物与芯片上探针杂交.杂交结果经荧光扫描并用特定软件分析判断,以此确定样品基因型.结果 所有样本的HLA Ⅰ、Ⅱ类抗原基因分型均获成功.此中分辨度探针可分出598个Ⅰ类抗原等位基因,511个Ⅰ类抗原等位基因,可捡出Ⅰ类抗原特异性57个,Ⅱ类抗原特异性30个.结论 基因芯片用于HLAⅠ、Ⅱ类抗原分型可行.其分辨率高、特异性强,可用于HLA基因分型、骨髓移植、器官移植的HLA配型、与HLA有密切关系的遗传性疾病的人群筛查.