ShineRoar探针技术检测单核苷酸多态性

• 作者: 张俊 张晓膺 徐宁 朱江 牟琴峰 罗光华 许国锋 郑璐 陈陆俊 魏江
• 来源期刊: 中华检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 多态性,单核苷酸 基因型 受体,肿瘤坏死因子,Ⅱ型 载脂蛋白类
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 分子诊断研究
• 页码范围: 609-612
• 页数: 4页
• 分类号: R4
• 字数: 3144字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j.issn:1009-9158.2007.06.003

摘要

目的 建立一种低成本、高效率、操作简便的单核苷酸多态性(SNP)检测技术.方法 采用自行设计的"ShineRoar探针",结合融解曲线技术检测目的 基因SNP.并根据其工作原理分别对肿瘤坏死因子受体Ⅱ(TNFRⅡ)和载脂蛋白M(apoM)的基因多态性进行检测;同时用DNA测序技术鉴定ShineRoar探针技术的准确性.结果 融解曲线分析结果显示,某一基因的野生型及突变型纯合子分别在2个不同的融解温度出现融解谷.TNFRⅡ基因第6外显子196位突变(ATG→AGG)所产生的T和G等位基因的融解温度分别为(52.84±0.75)℃和(58.38±0.61)℃;apoM T-778C突变所产生的T和C等位基因的融解温度分别为(42.55±0.73)℃和(49.19±0.57)℃.一致性Kappa检验显示ShineRoar探针技术与DNA测序技术的SNP检测结果一致(Kappa=1,P=0.000).结论 ShineRoar探针技术简单、快速、准确,适用于大批量基因分型的研究.