丹参功能基因组学研究Ⅰ——cDNA芯片的构建

• 作者: 付桂芳 唐晓晶 崔光红 王学勇 邱德 黄璐琦
• 来源期刊: 中国中药杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 丹参 cDNA芯片
• 年，卷（期）: 2007,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1137-1141
• 页数: 5页
• 分类号: S567
• 字数: 3859字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-5302.2007.12.005

摘要

目的:构建丹参cDNA芯片,为基因表达谱研究提供条件.方法:采用CTAB法提取丹参根总RNA,采用Pharmacia公司QuichprepTMMicro mRNA PurifiCation Kit分离mRNA后,通过在cDNA分子两端加上EcoR Ⅰ/Not Ⅰ接头,在T4多核苷酸激酶的作用下磷酸化,与表达载体λZAP Express Predigested Vector连接,然后用包装蛋白在体外包装连接产物,感染E.coli XL1-Blue MRF'构建成cDNA文库.挑取分离良好的噬菌斑进行PCR扩增,经过电泳检测、纯化、再次电泳检测后得到的克隆用于芯片点制.以丹参actin基因作为阳性对照,不含DNA的点样液和PolyA为阴性对照.结果:cDNA文库插入片段长度为500～2 500 bp.共得到4 354个克隆用于芯片点制.单色荧光(Cy3)杂交显示,阳性对照均出现杂交信号,阴性点没有杂交信号.整张芯片背景清晰,漏点少,杂交点为完整的圆形,芯片质量完好.结论:该芯片的制作为首张有关道地药材的cDNA芯片,为丹参功能基因组的研究提供了强有力的工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄璐琦	中国中医科学院中药研究所	500	10193	46.0	73.0
2	崔光红	中国中医科学院中药研究所	49	969	20.0	29.0
3	唐晓晶	中国中医科学院中药研究所	12	185	7.0	12.0
4	邱德	中国林业科学院林业研究所	1	32	1.0	1.0
5	王学勇	中国中医科学院中药研究所	10	288	8.0	10.0
6	付桂芳	中国中医科学院中药研究所	16	358	8.0	16.0