HeLa细胞感染痢疾杆菌前后差异表达的新EST序列的电子延伸及验证

• 作者: 史兆兴 胡福泉 袁静 黄留玉
• 来源期刊: 世界华人消化杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 痢疾杆菌福氏2a 表达序列标签 cDNA微阵列 电子延伸 反转录聚合酶链反应 基因鉴定
• 年，卷（期）: 2007,（17）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1905-1913
• 页数: 9页
• 分类号: R3
• 字数: 9053字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-3079.2007.17.006

摘要

目的:研究痢疾杆菌福氏2a入侵前和入侵后3 h的人上皮细胞差异表达的新基因.方法:采用增毒的痢疾杆菌福氏2a 2457T侵袭HeLa细胞,检查HeLa细胞中细菌的数量并用RT-PCR方法从HeLa细胞中提取总RNA,制备探针.采用含有约3000个代表新基因的芯片进行芯片杂交,分析杂交结果.将所获得的新的156条EST序列为种子序列用cDNA微阵列实验,以人类EST数据库为基础库,应用SiClone软件进行EST拼接、校对并尽可能延长获得大片段或全长cDNA.选取基因组未注释的编码区序列作为新基因进行RT-PCR实验验证.结果:共鉴定到≥3倍或≤0.33的差异表达的代表新基因的EST序列45条,其中25个延伸序列鉴定为与重要的肠道功能相关的已知基因,并有3个在痢疾杆菌侵袭期间高表达的存在显著差异的新EST序列,他们分别名为:NPCCKHl2、ADBCSB02和HTBAMG05,这3个基因是新的人基因或假基因.结论:鉴定出了在HeLa细胞感染痢疾杆菌前后差异表达的新EST序列,为进一步研究痢疾杆菌与寄主相互作用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄留玉	军事医学科学院疾病预防控制所	86	1108	18.0	30.0
2	袁静	军事医学科学院疾病预防控制所	34	178	7.0	11.0
3	史兆兴	军事医学科学院疾病预防控制所	21	252	6.0	15.0