中国大陆野猪SLA DRB基因exon2的序列变异分析

• 作者: 丁栋 周开亚 常青 张保卫 张晨岭 李崇奇 沈菲菲
• 来源期刊: 兽类学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 野猪 DRB exon 2 遗传变异 平衡选择 系统发生
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 117-125
• 页数: 9页
• 分类号: Q786
• 字数: 5817字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1050.2008.02.002

摘要

本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon 2序列的遗传变异分析,探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征.研究发现DRB基因exon 2抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2.95倍,表明该位点受到平衡选择的强烈作用.在系统发生分析中,在基于核苷酸序列构建的NJ树中,野猪DRB位点的15种等位基因全部聚为一枝,没有发现跨种多态现象;而在基于氨基酸序列构建的系统发生树中,野猪SLA-DRB*nnu6和人DRB基因exon 2片段聚在一起,这种氨基酸残基的高度相似可能是由于自然选择压力下产生的趋同.野猪DRB基因exon 2的序列多态性分析表明,东北野猪基因多态性低于四川野猪和华南野猪,这可能与不同气候条件和地理环境下的寄生虫等因素对SLA等位基因变异的影响存在差异有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周开亚	南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所	146	3794	37.0	55.0
2	常青	南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所	38	611	12.0	24.0
3	张保卫	安徽大学生命科学学院	29	183	8.0	12.0
4	李崇奇	海南医学院基础医学部	23	64	4.0	7.0
5	张晨岭	南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所	4	25	3.0	4.0
6	丁栋	南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所	1	5	1.0	1.0
7	沈菲菲	南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所	1	5	1.0	1.0