2003～2007年中国风疹病毒基因特征分析

• 作者: 何吉兰 凌华 周淑洁 孙莉 巴卓玛 张珍英 张红 戴德芳 朱贞 李聪勇 梁勇 毛乃颖 王飞霞 蒋小泓 詹军 许文波 许松涛 郑蕾 陈慧 陈霞
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 风疹病毒 基因特征 基因型
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 7-16
• 页数: 10页
• 分类号: R373.1
• 字数: 7116字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2008.01.002

摘要

本研究用Vero细胞或Vero/SLAM细胞从我国10个省(直辖市、自治区,下同)2003～2007年风疹暴发和散发病例的咽拭子标本中分离到57株风疹病毒,用RT-PCR方法扩增了57株风疹病毒E1基因1 107个核苷酸的片段,并对该PCR产物进行序列测定和分析.结果提示,在基于WHO基因定型靶序列739个核苷酸片段构建的基因亲缘关系树上,其中55株风疹病毒株属于1E基因型,相对于其他国家的1E基因型,形成一个独立分支;另外2株风疹病毒属于2B基因型.57株风疹病毒大部分核苷酸的突变为无义突变,氨基酸序列高度保守,除了2株风疹病毒在E1蛋白血凝抑制和中和位点区域第212位氨基酸由Thr变为Ser,其他病毒株均无重要抗原位点的改变;所有我国已分离到的1E基因型风疹病毒在E1蛋白第338位氨基酸共享突变位点(Leu338→Phe338),而其他基因型以及其他国家的1E基因型风疹病毒在该位点均未发生突变,提示该氨基酸(Phe338)可能是我国1E基因型风疹病毒所特有.2003～2007年在我国10个省均分离到1E基因型,而2B基因型只在2006年从四川省的越南输入病例中分离到,提示1E为绝对优势基因型,2B基因型为输入基因型.与1979～1984年和1999～2002年我国流行的风疹基因型不同,发生了基因型的更替,近年我国风疹的流行是由1E基因型为主的风疹野病毒的多个传播链引起.